近代广州，有很多对后世影响深远的历史事件，思想启蒙运动。作为这些历史事件的记忆，很多历史遗迹留存至今。比如三元里，洪秀全故居，万木草堂，黄花岗，黄埔军校，国民党“一大”旧址，中共三大会址，农民运动讲习所（番禺学宫）等等。
中法战争结束不久，清光绪十七年（1891年）春，应弟子陈千秋、梁启超之请，康有为在广州租借“邱氏书室”（在今广州中山四路长兴里3号），创办长兴学舍，开设讲堂宣扬维新变法思想，培养变法人才。第二年，迁讲堂于卫边街邝氏祠（在今吉祥路）。1893年冬再迁于广府学宫仰高祠（在今文德路），此时方悬挂“万木草堂”匾额，取自翰林梁鼎芬《赠康长素布衣》中“万木森森一草堂”句，意为“培植万木，为国家培养栋梁之才”。1898年9月，戊戌变法失败，万木草堂随即被封。
后世将上述三处讲堂统称为“万木草堂”。邝氏祠和仰高祠今已不存，唯有“邱氏书室”保留至今，被辟为“万木草堂旧址”加以保护纪念。现悬挂的匾额“万木草堂”四字为集字自康有为真迹。
梁鼎芬《赠康长素布衣》
牛女星文夜放光，樵山云气郁青苍。
九流混混谁真派，万木森森一草堂。
岂有尊才疏北海，空思三顾起南阳。
搴兰揽茝夫君急，蕉萃行吟太自伤。据学者李肖聃（曾任梁启超秘书）考证，康有为早年在南海西樵山三湖书院学习时，好友梁鼎芬前去探访，并送了这首诗。
邱氏书室由增城举人邱觉黄在1804年（清嘉庆九年）倡议，经由“广东十府十州八十县”的邱姓决议，集资白银1600两，于1808年始建。书室为三间三进、两天井、硬山顶的祠堂式建筑。碌灰筒瓦，两边保留有部分灰塑，青砖墙石脚，砖木结构，面阔三间，深三进，面积约为663平方米。门额上刻有“邱氏书室”四个大字。
有清一代，为规避官府的禁祠行动，位于省城广州的合族祠，各姓宗祠等多冠以“书院”，“书室”等名（详情可参考阅读之前博文–陈家祠），“邱氏书室”自然也不例外。“邱氏书室”的选址和设立，既是为了邱氏子弟在此学习，方便他们前往附近的番禺学宫（几步之遥）参加科举考试，也是邱氏家族祭祀先祖的地方。
值得一提的是，作为姓氏，邱原本应写作为丘，为避孔子（字孔丘）讳而写作邱。辛亥鼎革之际，闽粤两省邱姓族人倡复丘姓，其中最具代表性的人物丘逢甲，一般不写作邱逢甲。
1896年6月，晚清爱国诗人丘逢甲作为丘氏后人来到万木草堂（“邱氏书室”），在这里落脚借住，生活于此。
丘逢甲《春愁》
春愁难遣强看山，往事惊心泪欲潸。
四百万人同一哭，去年今日割台湾！
1953年，邱氏书室被政府接管，一度他用。1983年，万木草堂被列为广州市重点文物保护单位，2012年10月，它被公布为广东省文物保护单位。2019年10月，它又被公布为第八批全国重点文物保护单位。
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